Трнавский университет — университет в городе Трнава, существовавший в 1635—1777 году, один из первых университетов в Словакии.

Университет основал кардинал Петер Пазмань в 1635 году. Изначально было два факультета: философский и богословский. В 1665 году была создан правовой, а в 1770 году — медицинский факультет. Университет стал известен благодаря своей обсерватории, которую создал астроном Максимилиан Гелл, университетской библиотеки, садов и театра. В университете преподавали профессора Франтишек Кери, Ян Баттист Хорват, Андрей Яслинский.

Университет существовал до 1777 года, когда он был перемещён в Буда (Будапешт). Его правопреемником является Университет Лоранда Этвеша в Будапеште. Последним ректором университета (до его перемещения) был словацкий философ Андрей Яслинский (1715-1784).

25 марта 1992 года в городе Трнава был открыт новый университет, который, не будучи официальным преемником, продолжает древние традиции.