14-10-2023
Шифр КФ (Классификация ферментов) или код фермента — это классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для стандартизации исследований.
Классификация ферментов основана и периодически обновляется Комиссией по ферментам (англ. Enzyme commission, отсюда термин «EC number», принятый в англоязычной литературе) при Международном союзе биохимии и молекулярной биологии. Каждый шифр КФ ассоциирован также с рекомендованным названием соответствующего фермента. Классифицировано более 3500 ферментов.
Содержание |
Классификация ферментов учитывает реакционную и субстратную специфичности ферментов, а не их белковую структуру. Шифр КФ определяет химическую реакцию, катализируемую ферментом. По этой причине аналогичные ферменты (иногда десятки) из различных организмов имеют один КФ, несмотря на структурные различия.
Иногда различные ферменты одного организма имеют один КФ. Например, 3.1.1.3 благодаря катализированию одной химической реакции (гидролиз эфирной связи в триглицериде), хотя первый фермент является ферментом пищеварения и работает в кишечнике, а второй относится к ферментам обмена липопротеинов в крови.
Существует база данных UniProt [1] , которая идентифицирует каждый белок по его первичной последовательности. Обе базы данных дополняют друг друга.
Каждый классификационный номер содержит сокращение КФ и последовательность из четырёх чисел, разделённых точкой, и составляется по определенному принципу. Каждое последующее число представляет собой всё более и более уточняющую классификацию фермента. Так как база данных постоянно обновляется коды могут меняться и некоторые коды могут оставаться незаполненными.
Наконец, все ферменты, относящиеся к данному под-подклассу, получают свой порядковый номер (четвёртое число в шифре).
Класс | Катализируемая реакция | Тип реакции | Важнейшие подклассы |
---|---|---|---|
КФ 1 Оксидоредуктазы |
Окислительно-восстановительные реакции. Перенос атомов H и O или электронов от одного субстрата на другой | AH + B → A + BH (восстановленный) A + O → AO (окисленный) |
дегидрогеназа, оксидаза, пероксидаза, редуктаза, монооксидаза, диоксигеназа |
КФ 2 Трансферазы |
Перенос функциональной группы от одного субстрата на другой. Это может быть метильная, ацильная, фосфатная группа или аминогруппа. | AB + C → A + BC | аминотрансфераза, фосфотрансфераза, C1-трансфераза, гликозилтрансфераза |
КФ 3 Гидролазы |
Образование двух продуктов из одного субстрата в результате гидролиза. | AB + H2O → AOH + BH | эстераза, гликозил-гидролаза, пептидаза, амидаза |
КФ 4 Лиазы (синтазы) |
Негидролитическое добавление или удаление группы к или от субстрата. Образование C-C, C-N, C-O или C-S связи. | RCOCOOH → RCOH + CO2 | C-O-лиаза, C-S-лиаза, C-N-лиаза, C-C-лиаза |
КФ 5 Изомеразы |
Внутримолекулярная перестановка, то есть изомеризация молекулы субстрата. | AB → BA | эпимераза, цис-транс-изомераза, внутримолекулярная оксидоредуктаза и др. |
КФ 6 Лигазы (синтетазы) |
Соединение двух молекул в результате синтеза новой C-O, C-S, C-N или C-C связи, сопряжённое с одновременным гидролизом АТФ. | X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi | C-O-лигаза, C-S-лигаза, C-N-лигаза, C-C-лигаза |
Схема номенклатуры ферментов была впервые разработана в 1955 году, когда Международный конгресс биохимии в Брюсселе учредил Комиссию по ферментам (Enzyme Commission). Первая версия номенклатуры появилась в 1961 году и включала около 900 ферментов, в версии 1978 года было более 2000 ферментов. Версия 1995 года содержит более 3500 ферментов.
Шифр КФ.