В виду того,что шымкентские команды «Динамо» и «Кеден», ставшие золотым и серебряным призерами первой лиги образца 1999 года, отказались выступать в высшей лиге, в нее была допущена «Акмола» из Кокшетау, занявшаяв первенстве первой лиги-99 третье место. Эта команда заменила занявший всезоне-99 в высшей лиге последнее место одноименный клуб из Степногорска. Решено было сохранить место в высшей лиге талдыкорганскому «Жетысу», занявшемув ней в 1999 году предпоследнее место и поначалу считавшемуся выбывшей изглавного дивизиона командой. Проведя ровно половину матчей чемпионата, объединились в один клуб шымкентские клубы «Томирис» и «Жигер». Объединенная команда была названа весьма символично — «Достык», что в переводе с казахского языка означает «дружба». В турнирной таблице «Достык» стал приемником имевшей лучшие показатели «Томирис». Что касается «Жигера», то согласно Регламенту соревнований по футболу в Республике Казахстан, его присутствие в турнирной таблице чемпионата было сохранено, так как он сыгралв нем более 50 % матчей. В оставшихся играх «Жигеру» были засчитаныпоражения со счетом 0:3. Экибастузкий «Батыр» снялся с чемпионата. За победу во IХ чемпионате Республики Казахстан по футболу начислялось 3 очка, за ничью 1 очко. Проигравшие команды очкине получали. Названия команд даны в соответствии со временем их переименований. Турнирное положение команд с равным количеством набранных очков дано с учетом определения приоритетов, оговаривавшихся Регламентом соревнований по футболу в Республике Казахстан. При равенстве количества набранных очков при определении мест претендентов учитывалось в первую очередь: наибольшее количество побед, забитых мячей,разность забитых и пропущенных мячей или жребий. Однако эти показатели не вступают в силу, если одинаковое количество очков набирают команды, претендующиена первое место. В этом случае между ними проводится дополнительный матч, что во второй раз в истории чемпионатов РК среди команд высшей лиги произошло в последнем сезоне ХХ века. Первый раз «золотой» матч состоялся в 1997 году. Лучшие игроки по линиям и лучший игрок сезона определялисьпо итогам опроса главных тренеров команд.

Турнирная таблица

• С ЦСКА "Кайрат" за несвоевременную уплату заявочного взноса снято 3 очка.
  • С "Батыр" за несвоевременную уплату заявочного взноса снято 6 очков, позже по финансовым причинам команда снялась с чемпионата.
    • Результаты матчей с участием "Батыра" аннулированы

Результаты матчей

• Курсивом выделены технические результаты
  • Результаты матчей с участием "Батыра" аннулированы

Золотой матч