Docking@Home

Docking@Home

Тип	Распределённые вычисления
Операционная система	Кроссплатформенное ПО
Аппаратная платформа	x86
Последняя версия	• Charmm 34a2: 6.23
Состояние	Активное
Сайт	http://docking.cis.udel.edu/

Docking@Home
Платформа	BOINC
Объём загружаемого ПО	7.7 МБ
Объём загружаемых данных задания	1.2 МБ
Объём отправляемых данных задания	75—100 КБ
Объём места на диске	11 МБ
Используемый объём памяти	169 МБ
Графический интерфейс	есть
Среднее время расчёта задания	5.5 часов
Deadline	14 дней
Возможность использования GPU	нет

Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).^[1]

Докинг

Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.^[2] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.^[1]

Детали проекта и статистика

Графика из программы-клиента

Научные достижения

Примечания

↑ http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 pdf
Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1

См. также

Добровольные вычисления

BOINC

Ссылки

Официальный сайт проекта

Российский сайт распределённых вычислений

Научные публикации

Проекты добровольных вычислений

Астрономия

Albert@Home • Asteroids@home • Constellation • Cosmology@home • Einstein@Home • MilkyWay@home • Orbit@home • PlanetQuest • SETI@home • theSkyNet POGS

Биология и
медицина

Biochemical Library • Cels@Home • CommunityTSC • Correlizer • Docking@Home • DrugDiscovery@Home • DNA@Home • evo@home • evolution@home • FightAIDS@Home • FightMalaria@Home • Folding@home • GPUGrid • Lattice Project • Malariacontrol.net • Neurona@Home • NRG • Poem@Home • Predictor@home • Proteins@Home • QMC@Home • RALPH@Home • RNA World • Rosetta@home • SIMAP@home • SimOne@home • Superlink@Technion • United Devices Cancer Research Project • Volpex@UH • Wildlife@Home

Когнитивные

Artificial Intelligence System • MindModeling@Home

Климат

APS@Home • BBC Climate Change Experiment • ClimatePrediction.net • Seasonal Attribution Project • Quake Catcher Network - Seismic Monitoring • Virtual Prairie

Математика

ABC@home • AQUA@home • Chess960@home • Collatz Conjecture • distributed.net • Enigma@Home • EulerNet • GIMPS • NFSNET • NQueens Project • NumberFields@Home • OProject@Home • PiHex • PrimeGrid • Ramsey@Home • Rectilinear Crossing Number • SAT@home • SHA-1 Collision Search Graz • SubsetSum@Home • RainbowCrack • Seventeen or Bust • SZTAKI Desktop Grid • WEP-M+2 Project • Wieferich@Home • VGTU@Home

Физико-
технические

BRaTS@Home • CuboidSimulation • eOn • Hydrogen@Home • Leiden Classical • LHC@home • Magnetism@home • µFluids@home • Muon1 DPAD • NanoHive@Home • SLinCA@Home • Solar@Home • Spinhenge@home • QuantumFIRE

Многоцелевые

AlmereGrid • CAS@Home • EDGeS@Home • Ibercivis • Optima@home • World Community Grid • Yoyo@home

Прочие

Africa@HOME • BURP • DepSpid • DIMES • Ideologias@Home • FreeHAL@home • Gerasim@Home • Pirates@Home • RenderFarm@Home • RND@home • Surveill@Home • YAFU

Утилиты

BOINC (Account Manager • Manager • client-server technology • Credit System • Wrapper • WUProp)

Это заготовка статьи по биохимии. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её.

Это заготовка статьи о программном обеспечении. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её.

Light-industry-up.ru

Экосистема промышленности

Публикации