Thermococci (Термококки) — класс Эвриархеот[1][2], состоит из единственного семейства Thermococcaceae (3 рода, более 30 известных видов), которое является самым многочисленная семейством в домене архей. Вероятно, изучена лишь небольшая часть существующих в природе видов этого класса[3].
Характеризуются очень высокой температурой оптимального роста (80 °С выше) при pH среды близкой к нейтральной (оптимум у большинства лежит в пределах 6-8) и солёности, близкой к солёности морской воды. Наиболее частые места обитания — подводные гидротермальные источники. Представители рода Thermococcus обнаружены также в наземных гидротермах Новой Зеландии. Сведений об обитании термококков в аэробных и низкотемпературных экосистемах и в средах с высоким или низким pH в настоящее время нет[3].
Классификация
Описано более 30 видов термококков, относящихся к трём родам[4]:
- Класс Thermococci Zillig and Reysenbach 2002 (синоним: Protoarchaea Cavalier-Smith 2002)
- Порядок Thermococcales
- Семейство Thermococcaceae
- Род Palaeococcus Takai et al., 2000
- Род Pyrococcus Fiala and Stetter, 1986
- Pyrococcus abyssi Erauso, Reysenbach, Godfroy et al., 1993
- Pyrococcus furiosus Fiala and Stetter 1986
- Pyrococcus glycovorans Barbier, Godfroy, Meunier et al., 1999
- Pyrococcus horikoshii Gonzalez, Masuchi, Robb et al., 1999
- Pyrococcus woesei Zillig, Holz, Klenk et al., 1987
- Pyrococcus yayanosii in press
- Род Thermococcus Zillig et al., 1983
- Thermococcus acidaminovorans Dirmeier, Keller, Hafenbradl et al., 2001
- Thermococcus aegaeus Arab, Volker & Thomm, 2000
- Thermococcus aggregans Canganella, Jones, Gambacorta et al., 1998
- Thermococcus alcaliphilus Keller, Braun, Dirmeier et al., 1997
- Thermococcus atlanticus Cambon-Bonavita, Lesongeur, Pignet et al., 2004
- Thermococcus barophilus Marteinsson, Birrien, Reysenbach et al., 1999
- Thermococcus barossii Duffaud, d’Hennezel, Peek et al., 2005
- Thermococcus celericrescens Kuwabara, Minaba, Ogi et al., 2007
- Thermococcus chitonophagus Huber and Stetter 1996
- Thermococcus coalescens Kuwabara, Minaba, Iwayama et al., 2005
- Thermococcus fumicolans Godfroy, Meunier, Guezennec et al., 1996
- Thermococcus gammatolerans Jolivet, L’Haridon, Corre et al., 2003
- Thermococcus gorgonarius Miroshnichenko, Gongadze, Rainey et al., 1998
- Thermococcus guaymasensis Canganella, Jones, Gambacorta et al., 1998
- Thermococcus hydrothermalis Godfroy, Lesongeur, Raguenes et al., 1997
- Thermococcus litoralis Neuner, Jannasch, Belkin et al., 2001
- Thermococcus marinus in press
- Thermococcus onnurineus Bae, Kim, Yang et al., 2006
- Thermococcus pacificus Miroshnichenko, Gongadze, Rainey et al., 1998
- Thermococcus peptonophilus Gonzalez, Kato & Horikoshi, 1996
- Thermococcus profundus Kobayashi, Kwak, Akiba et al., 1995
- Thermococcus radiotolerans in press
- Thermococcus siculi Grote, Li, Tamaoka et al., 2000
- Thermococcus stetteri Miroshnichenko, Bonch-Osmolovskaya, Neuner & Kostrikina, 1990
- Thermococcus thioreducens Pikuta, Marsic, Itoh et al., 2007
Примечания
- Thermococci. NCBI taxonomy resources. National Center for Biotechnology Information. Проверено 14 ноября 2011.
- Микробиология: Учебник — M.: Изд-во Моск ун-та, 1985. — 376 c.
- ↑ Молекулярная детекция представителей гипертермофильных архей и характеристика архейной термостабильной ДНК-полимеразы : диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.07. - Москва, 2005. - 118 с. : ил. РГБ ОД.
- Thermococci.
Литература
- Cavalier-Smith, T (2002). «The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1): 7–76. PMID 11837318.
- Woese, CR; Kandler O, Wheelis ML (1990). «Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 (12): 4576–4579. 10.1073/pnas.87.12.4576. PMID 2112744. 1990PNAS...87.4576W.
- Zillig W, Reysenbach AL Class IV (sic) [V]. Thermococci class. nov. // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria / DR Boone and RW Castenholz, eds.. — 2nd. — New York: Springer Verlag, 2001. — P. 169. — ISBN 978-0387987712
- Garrity GM, Holt JG Phylum AII. Euryarchaeota phy. nov. // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria / DR Boone and RW Castenholz, eds.. — 2nd. — New York: Springer Verlag, 2001. — P. 169. — ISBN 978-0387987712
- Atomi, H., Fukui, T., Kanai, T., Morikawa, M, and Imanaka, T. Description of Thermococcus kodakaraensis sp. nov., a well studied hyperthermophilic archaeon previously reoprted as Pyrococcus sp. KOD1]. April 16, 2004. Archaea 1, p. 263—267.
- Fukuda, W., Ismail, Y. S., Fukui, T., Atomi, H., and Imanaka, T. Characterization of an archaeal malic enzyme from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis KOD1. January 6, 2005. Archaea 1, p. 293—301.
- Fukui, T., Atomi, H., Kanai, T., Matsumi, R., Fujiwara, S., and Imanaka, T. Complete genome sequence of the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis KOD1 and comparison with Pyrococcus genomes. February 14, 2005. Genome Research 15. p. 352—363.
- Jolivet, E., L’Haridon, S., Corre, E., Forterre, P., Prieur, D. Thermococcus gammatolerans sp. nov., a hyperthermophilic archaeon from a deep-sea hydrothermal vent that resists ionizing radiation. 2003. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53, p. 847—851.
- Miroshnichenko, M. L., Gongadze, G. M., Rainey, F. A., Kostyukova, A. S., Lysenko, A. M., Chernyh, N. A., and Bonch-Osmolovskaya, E. A. Thermococcus gorgonarius sp. nov. and Thermococcus pacificus sp. nov.: heterotrophic extremely thermophilic archaea from New Zealand submarine hot vents. 1998. International Journal of Systematic Bacteriology 48, p. 23-29.
Ссылки
- Ссылки на PubMed для Thermococci
- Ссылки на PubMed Central для Thermococci
- Ссылки на Google Scholar для Thermococci
- Таксономия на NCBI для Thermococci
- Искать в Tree of Life таксономию для Thermococci
- Искать в Species2000 страницы о Thermococci
- Страница в MicrobeWiki о Thermococci
- Страница в LSPN о Thermococci
- Список литературы по гипертермофильным археям.